Uma atualização parcial às vezes é necessária se certas dependências de pacotes forem alteradas durante uma atualização. Ele não irá atualizá-lo para qualquer outra versão do Ubuntu, a menos que você tenha alterado manualmente suas fontes apt para apontar para uma nova versão.
Se você escolher Continuar nesse diálogo, deverá ver a lista de pacotes a atualizar. Alguns deles podem não ser selecionáveis. O que Upgrade Parcial faz, são os bits extras necessários para resolver as dependências desses pacotes. Geralmente, isso significa instalar um novo pacote ou dois.
É perfeitamente seguro e normal que esta solicitação Atualização Parcial aconteça, dependendo dos pacotes que você instalou.