Existem muitas origens diferentes, dependendo da combinação de hardware e software que você instalou em seu sistema.
Se eu tivesse que adivinhar, eu diria que o cursor que você está vendo está sendo desenhado pelo BIOS ou pelo bootloader.
Durante uma inicialização UEFI, algumas placas-mãe têm um prompt básico que você pode acessar e digitar comandos antes que qualquer software seja carregado de um disco. Este programa reside no BIOS UEFI.
VEJA: link
Não estou ciente de nada como isso que existe para uma inicialização do MBR herdado.
Eu vi uma placa-mãe que exibe um cursor intermitente entre o menu de configuração do POST e do RAID. Isso está sendo exibido pelo BIOS. Não é um prompt.
O gerenciador de inicialização do Windows também pode exibir um cursor piscando às vezes. Isso pode ter suas raízes no DOS ou no código antigo do NT, mas também não é um prompt.
INFORMAÇÕES ESPECÍFICAS DO WINDOWS: link
Para mais informações sobre o processo de inicialização e quais são as etapas: