Usando o sistema de arquivos NTFS no Ubuntu 14.04, isso prejudica o disco rígido?
Não. Dano isso não acontece. Mas a questão é um pouco estranha (por que um sistema de arquivos prejudicaria um disco rígido?)
Existe alguma desvantagem de usar o sistema de arquivos ntfs no Ubuntu?
Você não pode instalar o Ubuntu em NTFS. O "/" e a partição "/ home / dependem do POSIX (as permissões chmod e chown são parte disso) e o NTFS não suporta isso.
Você pode colocar "/" e "/ home /" no EXT e ter os diretórios em "/ home /" (isto é, documentos, imagens, downloads) em um sistema de arquivos NTFS e até compartilhá-los entre outros usuários nesse sistema . Em geral, você pode colocar todos os seus dados pessoais em NTFS.
Se você usar o NTFS, é aconselhável ter sempre um Windows no sistema (inicialização dupla; você pode ocultar o menu de inicialização para que não o veja, a menos que inicialize no grub e escolha o Windows para inicializar). Se ficar danificado, é melhor usar ferramentas de reparo dedicadas do Windows.