Você pode manter a partição NTFS com seus arquivos, se tiver espaço livre suficiente. Apenas reduza a partição NTFS, instale o Ubuntu e copie seus arquivos para uma partição do Ubuntu.
Depois disso, você poderá remover com segurança a partição NTFS e expandir a (s) partição (ões) do Ubuntu.
Essa é uma das formas de não envolver o armazenamento externo.