Ocultar sua janela com uma tarefa agendada
Crie uma tarefa agendada para executar seu comando, mas configure a tarefa para ser executada no contexto da conta de usuário SYSTEM. Quando a tarefa é executada, ela não estará em sua sessão de usuário e, portanto, as janelas abertas não estarão visíveis para você.
Para fazer isso, crie a tarefa e, em seguida, na guia Geral das propriedades da tarefa, configure a opção Ao executar a tarefa, use a seguinte conta de usuário para usar a conta SYSTEM
. Não deixe a tarefa executar com sua própria conta de usuário, caso contrário, você ainda verá a janela do console piscando.
Você pode então executar a tarefa On Demand ou agendá-la para ser executada quando desejado.