Das opções já citadas:
1) Apenas use o Backtrack em uma VM - mais fácil, mas alguns dos pacotes estão relativamente quebrados a partir de agora e alguns dos pacotes estão desatualizados
2) Compile tudo a partir da fonte - Sim, realmente. Isso é mais fácil do que solucionar problemas de todos os SNAFUs de adicionar os repositórios BT.
3) Debianise tudo adequadamente para construir contra o Ubuntu atual - trabalho constante em progresso e não muita comunidade em torno dele.
4) Adicione os repositórios do Backtrack - a pior opção. Parece a melhor opção fora do portão, mas você terá problemas e muitos deles.