O requisito que o aplicativo precisa instalar em / opt tem poucas exceções. E como é por causa das diretrizes de submissões do ARB, você pode verificar esta página para mais detalhes.
De acordo com ele, uma das exceções à regra / opt é o arquivo .desktop. Então você pode ir em frente e instalá-lo em / usr / share / applications, contanto que você adicione um prefixo "extras-" ao seu nome.