Eles não podem ser nomes exatamente iguais ou, se fossem, não poderiam estar no mesmo diretório. Mas de qualquer forma, se você estiver no mac ou no linux, instale o pdftk com o seu gerenciador de pacotes. Depois disso, corra
pdftk *.pdf cat output out.pdf
Se eles estiverem em diretórios separados, use um comando find no lugar de * .pdf, caso contrário, certifique-se de estar no diretório com os pdfs antes de executar o comando.
EDIT Você disse que eles estavam em diretórios separados, então é só rodar
pdftk $(find . -name robot.pdf) cat output out.pdf
Se eles tiverem nomes diferentes, modifique o comando conforme necessário ou faça isso com * .pdf como o -name, mas isso pode incluir arquivos indesejados.