Tópico bastante antigo, mas ainda pode ser útil ...
- Você poderia ter usado links físicos, para ter esses arquivos em ambos os locais ao mesmo tempo, sem copiá-los. O LinkShellExtension torna isso muito fácil.
- Os arquivos que foram copiados terão uma data de criação diferente (mais recente); os arquivos que foram movidos terão retido sua data original de criação. Assim, procurar por arquivos de acordo com a data de criação pode ser uma solução em um caso como esse.
- WinMerge2011 (uma bifurcação do WinMerge original) tem a opção de comparar pastas com suas subpastas, mas ignora a estrutura das subpastas: basta clicar na caixa ao lado de "Incluir subpastas" uma vez para tê-la "meio marcada" e ativar essa opção; clicar uma segunda vez fará com que ela ignore completamente as subpastas. Eu ainda não testei essa função, então não posso comentar sobre sua eficiência ou relevância em um caso como esse.
- AllDupe, um localizador de arquivos duplicado, agora inclui a opção de exibir apenas não-duplicados, ou seja, arquivos que são exclusivos nas pastas que estão sendo analisadas. Para que isso continue mais rápido se essas pastas tiverem muitos arquivos grandes e você desejar recriar a estrutura original da pasta de origem, ela provavelmente poderá ser configurada para digitalizar ambas as pastas por tamanho e / ou nome e / ou data de modificação, sem ler o arquivo. conteúdo dos arquivos (mas ainda é recomendado, você nunca sabe quando a corrupção pode ocorrer).