Pare o cupsd executando
sudo stop cups
Em seguida, edite /etc/cups/printers.conf com o seu editor favorito.
Encontre a linha que diz
<DefaultPrinter somename>
E mude para
<Printer somename>
Em seguida, comece cupsd com
sudo start cups
E isso deve remover a impressora padrão, revertendo a impressão para arquivo como padrão.