Não, não é um bug. Alguns temas do Metacity (como o Clearlooks) usam as cores definidas pelo usuário, enquanto outros temas (como o Ambiance e o Radiance) codificam as cores usadas. Se você quiser alterar as cores, terá que editá-las manualmente.
Quando eu altero a cor das entradas do menu realçadas para clearlook, a borda da janela também é afetada. Este não é o caso com Ambiance ou Radiance. Por quê? É um erro ou pretendido?
Não, não é um bug. Alguns temas do Metacity (como o Clearlooks) usam as cores definidas pelo usuário, enquanto outros temas (como o Ambiance e o Radiance) codificam as cores usadas. Se você quiser alterar as cores, terá que editá-las manualmente.