Na verdade, estou executando o KDE 4.9.4 sobre o ArchLinux, mas não importa. Como o KDE trata a tela como uma (principalmente), a mudança de Desktops Virtuais irá ligá-los em todas as telas. No entanto, há um prático botão "Em todos os desktops" em todas as janelas da barra de título (perto do logotipo do aplicativo, você ativa / desativa isso em SystemSettings- > WindowDecorations- > ConfigureButtons). Clique nele e seu aplicativo permanecerá lá mesmo se você alternar os desktops. É uma solução alternativa, mas funciona.