Tente o WinFF.
O WinFF é uma GUI para o conversor de vídeo da linha de comando, o FFMPEG. Será Converte mais qualquer arquivo de vídeo que o FFmpeg irá converter. O WinFF faz vários arquivos em vários formatos ao mesmo tempo. Você pode por exemplo converter mpeg, flv e mov, todos em avi de uma só vez. O WinFF é disponível para Windows 95, 98, ME, NT, XP, VISTA e Debian, Ubuntu, Distribuições GNU / Linux baseadas em Redhat.
WinFF é open source e cross platform escrito em Free Pascal e Lázaro O WinFF é publicado sob a licença pública GNU. O WinFF é publicado sem qualquer garantia ou adequação para qualquer finalidade. 1
Para instalar o WinFF Para o Ubuntu
1 Fonte: WinFF