Não sei qual é o problema, mas você pode tentar reparar o MBR e ver se funciona.
Para reparar o MBR e restaurar o carregador de inicialização do Windows 7, siga estas etapas:
- Inicialize o disco de instalação do Windows e escolha Reparar o seu computador .
- Selecione a instalação correta do Windows e será exibida a tela Opções de recuperação do sistema. Selecione Prompt de Comando.
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Use os seguintes comandos para restaurar o MBR: bootrec /fixmbr
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Ou reescreva o novo setor de inicialização na partição do sistema: bootrec /fixboot
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Reinicialize o sistema e veja se funciona.
Se reparar o MBR não funcionar para você, talvez a sua instalação esteja corrompida ou a unidade esteja falhando, sugiro que você faça backup dos dados usando um CD ao vivo e depois reinstalando o Windows.
Espero que isso ajude você.