Eu não acho que você pode fazer isso facilmente apenas para o Chrome. Sua melhor aposta para realmente mudar as chaves será trocar globalmente suas chaves de comando e controle nas Preferências do Sistema:
Como alternar as teclas de comando e controle
Concordo com o comentário de @Tetsujin de que é mais fácil se acostumar com a mudança de paradigma a longo prazo. O teclado da Apple é um pouco diferente, e parece estranho (para mim) tentar usar combinações de teclas do Windows nele.