Por isso!
O kernel é um novo pacote e não uma atualização de um antigo, por isso você não pode usar o comando upgrade
que atualiza / atualiza pacotes. Você precisa usar o comando dist-upgrade
para instalar novos pacotes.
Quando você atualizou para o novo kernel, você pode executar o antigo também. É por isso que é um novo pacote e não apenas uma atualização.