Não é uma prática recomendada compactar uma pasta do sistema operacional Windows. Existem muitas razões pelas quais você não deve, os principais são:
- Desempenho. O sistema operacional é a base da qual tudo depende. A compactação da pasta do sistema operacional exigirá que o SO descompacte e comprima constantemente para leituras / gravações nessa pasta. Como um sistema operacional, isso acontecerá o tempo todo enquanto você usa o sistema. Por exemplo, você definitivamente notará um impacto no desempenho do IE, uma vez que ele usa o cache de disco em algum lugar na pasta do SO, quando você o compacta, o IE fica lento.
- A recuperação é complicada. Se você precisar recuperar um sistema operacional com falha, será um desafio mesmo sem a compactação do disco. Colocar a compactação na pasta do sistema operacional tornará muito mais difícil recuperar um sistema operacional com falha.
- A verificação antivírus será mais lenta.
... e posso continuar, mas acho que essas três razões devem ser suficientes para não percorrer o caminho da compactação da pasta do sistema operacional Windows.