Usando um comando personalizado para o seu perfil de terminal de mate, por exemplo:
sh -c "cd your_folder; exec bash"
Substitua your_folder pela sua pasta preferida e bash pelo seu shell se precisar de outro que não seja bash
O terminal em ação
Se você cometeu um erro, use dconf-editor para corrigir seu problema:
sudo apt-get install dconf-editor
Inicie o dconf-editor e navegue até org.mate.terminal.profiles e altere os valores para custom-command e use-custom-command