Isso é definitivamente possível. Eu tinha feito isso anteriormente no meu Ubuntu. O que você precisará instalar é qjackctl , que é uma interface de usuário para controlar o JACK (Jack Audio Connection Kit).
Você terá que dar uma olhada em alguns tutoriais sobre como configurar e usar corretamente o JACK e, em seguida, você pode usar qjackctl para configurar qual saída do aplicativo vai para qual porta de áudio no seu computador. A tela de configuração de qjackctl é bastante intuitiva. Uma captura de tela como um exemplo:
