A maneira mais simples de corrigir este erro é apagar os arquivos - se eles estiverem danificados e ilegíveis, você não perderá nada que ainda não tenha desaparecido. Isso removerá as entradas do diretório para que o Nautilus não tente ler os arquivos quando abrir a pasta.
No entanto: os arquivos danificados podem indicar problemas no desenvolvimento com o hardware de armazenamento (disco rígido ou SSD) ou outro dano do sistema de arquivos nesse volume (pode ser causado pelo desligamento não programado do computador, especialmente quando os arquivos estão abertos) . Eu recomendo que você use um utilitário de verificação de disco para verificar se o sistema de arquivos está bem, assim como um S.M.A.R.T. leitor para verificar se o hardware não está falhando. Se o hardware está indo, você pode perder tudo armazenado nele ...
Uma outra recomendação, de comentários, é que se o sistema de arquivos em questão aqui for NTFS, use apenas ferramentas do Windows para repará-lo - mesmo que isso signifique conectar a mídia de armazenamento a um computador Windows você não terá o Windows na sua máquina Ubuntu.