Não, Favoritos são pastas únicas marcadas como favoritas. A idéia geral é separá-los da pilha de pastas, tornando-as mais visíveis (e mais fáceis de acessar).
Se as subpastas fossem incluídas, isso iria contra essa ideia.
Parece que você está tentando encontrar uma solução técnica para um problema humano. ;)