O NodeJS não deve interferir no LAMP, desde que você os esteja executando usando um número de porta diferente.
Por exemplo, Abaixo está um aplicativo NodeJS simples que está escutando na porta 3000 e servirá a página index.html usando essa porta. Ao mesmo tempo, o Apache ainda pode servir páginas da Web usando a porta 80 e enquanto as portas não confronto você não deve ter problemas com a execução de ambos os serviços.
var app = require('express')();
var http = require('http').Server(app);
var util = require('util')
var port = 3000;
app.get('/', function(req, res) {
res.sendFile(__dirname + '/index.html')
});
http.listen(port, function() {
console.log('listening on *:' + port);
});