Meu palpite é que, como você está removendo o Firefox, ele também quer remover o mecanismo de renderização que ele usa, o Gecko, que provavelmente é usado como uma dependência para alguns desses programas. Você poderia limpar o Firefox e manter todo o resto ignorando dependências, mas geralmente não é aconselhável.
Por outro lado, se você optar por fazer isso, ele não deverá tornar seu sistema inutilizável, mas poderá ser necessário que você o solte em uma linha de comando para reinstalar o Firefox se a GUI não carregar completamente.