Com base no modo 777 (rwxrwxrwx) que você está vendo, provavelmente está destacando o fato de que esses arquivos têm bits de mundo / outros, o que geralmente é considerado uma prática ruim.
Eu sugeriria o modo de configuração 770 (rwxrwx ---) nos diretórios e o modo 660 (rw-rw ----) nos documentos. No mínimo, você deve ser capaz de limpar os bits do mundo com chmod -R o-rwx
- que, no entanto, ainda deixará seus documentos 'executáveis', o que também é uma prática ruim.