Vamos dizer assim: a configuração de variáveis OpenMP como OMP_NUM_THREADS afeta somente programas usando OpenMP .
Como o OpenMP não lida com a GUI, a resposta é: ela afeta apenas o console!
A configuração de OMP_NUM_THREADS = 1 nas variáveis de ambiente global (via Painel de Controle - > Sytem - > variáveis de ambiente) afeta apenas os programas executados a partir do prompt de comando ou de todos os programas?