Primeiro, eu usaria uma das ferramentas SMART para analisar os erros de autodiagnóstico da unidade e veja se há alguma indicação de que o disco está indo mal. Isso significa Auto-Monitoramento, Análise e Tecnologia de Relatórios, e pode fornecer algumas informações. Possíveis falhas de hardware.
Outra ferramenta específica que vale a pena mencionar é SpinRite , que detalha todo o disco e é explicada em detalhes em seu site.
Isso não resolve um problema no nível do sistema operacional, mas você já fez a reinstalação.