Você pode usar o mklink para criar uma junção de diretório para a origem diretório. Com o mklink , todos os programas pensarão que estão acessando o diretório de origem na realidade, é apenas um link para o diretório de destino.
Use isto:
mklink /J C:\foo D:\bar
Isso faz com que os programas achem que estão acessando o C: \ foo, mas na realidade será D: \ bar