Eu tive o mesmo problema. Provavelmente é causado por fctix , que é algum software, que suporta métodos de entrada. Por alguma razão, eu não consegui matar este processo do terminal com sucesso. Eu encontrei no monitor do sistema gráfico e matei o processo da GUI. Depois disso, enquanto escrevia Ctrl + alt + B, o teclado estranho não era mais exibido. Você também pode tentar remover este software.
Instrução mostrando como remover o fctix pode ser encontrada aqui: link
Desinstalação:
sudo apt-get remove --auto-remove fcitx
Limpando dados de configuração:
sudo apt-get purge --auto-remove fcitx