Eu acredito que tenho um problema semelhante com o Unity no Ubuntu 15.10. Descobri que executar a ferramenta de ajuste de unidade e configurar o aumento automático para o modo de foco e para "mouse" obtém o comportamento desejado. Eu suspeito que você pode pular o aumento automático se você não gostar, mas o foco definido em "clique" é o que parece estar causando o problema para mim e "mouse" funciona como eu esperava.