O comando
optirun nvidia-smi
imprimirá a temperatura e algumas outras informações também.
ATUALIZAÇÃO: Os comentários abaixo sugerem que em alguns pacotes não oficiais do driver da nvidia, o binário nvidia-smi não está corretamente vinculado a /usr/bin/ . Se você tiver esse problema que o comando nvidia-smi não foi encontrado, consulte /usr/lib/nvidia-XXX/bin/nvidia-smi para o binário, em que XXX é o número da versão do driver. (Ou apenas faça um locate nvidia-smi ou um find / -name nvidia-smi para procurar pelo arquivo.) Se você encontrou o arquivo, basta vinculá-lo a /usr/bin/ para estar disponível como um simples comando, então faça algo assim:
sudo ln -s /usr/lib/nvidia-331/bin/nvidia-smi /usr/bin/nvidia-smi