Tudo o que você precisa fazer é configurar corretamente o seu provedor de serviços ftp. Eu uso VSFTPD, então minha configuração estava em /etc/vsftpd.conf
lá dentro, havia uma configuração comentada, #chown-uploads=YES
. depois de descomentar (removendo o símbolo da libra) todos os arquivos enviados via ftp eram de propriedade do usuário logado atualmente. Isso permitiu a edição fácil do notepad ++.