O que você descreve com o relatório do rastreador de bugs não parece ser o comportamento padrão. Você está fazendo tudo certo. Eu iria registrar um bug no rastreador de bugs do Tuleap.
Os modelos de rastreador padrão devem pertencer ao projeto de administração inicial. Se você removeu os rastreadores desse projeto ou definiu direitos restritivos, você não poderá mais usá-los como modelos.