O Windows 7 possui recursos de marcação integrados, mas está limitado a documentos do Office. Aqui está um dos muitos sites que descrevem isso.
TaggedFrog - Eu recentemente desinstalei isso depois de usá-lo por algumas semanas. Não se integra no Windows Explorer. Interface é desajeitada e não-statndard. Adicionar arquivos e marcá-los é tedioso e inconveniente.
Tag2Find - Eu usei isso por um ano ou mais. Tudo bem, mas talvez melhor polido agora. Integra-se com o Windows Explorer. Definitivamente melhor que TaggedFrog.