Eu sugeriria algumas coisas, nesta ordem -
Primeiro, use o formatador de associação de cartão SD conforme o guia de instalação do noobs - certifique-se, especificamente, de ativar a configuração" FORMAT SIZE SIZE ADJUSTMENT ".
Se isso não funcionar, inicialize no linux e use o 'shred' no dispositivo base do cartão sd para apagar a tabela de partições e tudo o mais na unidade. Crie uma nova tabela de partição com gparted ou fdisk e continue de acordo com o normal.
Também recomendo usar noobs uma imagem bruta, se possível, apenas para evitar que esse tipo de coisa aconteça.