Use ddrescue ou similar para puxar a partição desbloqueada para outro disco, para que você não corra o risco de estragar seu backup mestre. Talvez os daemontools ou algo assim lhe permitam anexar a imagem como um disco. Em seguida, use várias ferramentas para reparar o sistema de arquivos. Se você não conseguir consertá-lo, existem ferramentas como undelete360, magicrescue, sleuthkit. Puxar a imagem será muito mais fácil de um livecd como kali ou systemrescuecd (o kali tem truecrypt).