I was trying to install ...
Isso significa que o PC estava no processo de gravação no disco.
ChkDisk entrando na reinicialização é esperado e comportamento normal, e pelo que você digitou eu não posso dizer que existe um problema real, além de sua instalação pela metade.
Você pode ter entradas nos registros do sistema que mostrarão pelo menos alguns detalhes sobre o que o chkdisk realmente fez.
Se você executar novamente o chkdisk e ele informar que tudo está OK (sem alterações), não será necessário se preocupar.