Os backups do Time Machine são todos incrementais quando o primeiro backup completo é feito. Mas o sistema não é nada inteligente em lidar com mudanças de nome. Se você renomear um diretório, o Time Machine tratará a alteração como se o diretório antigo fosse excluído e um novo diretório fosse criado com todos os mesmos arquivos nele. Como considera o diretório novo, cópias novas de tudo serão feitas.
A alteração do proprietário ou das permissões de um arquivo também acionará a criação de uma nova cópia de backup, mesmo que o conteúdo do arquivo não tenha sido alterado. A alteração das permissões do diretório não aciona backups recentes de tudo abaixo, no entanto.