A correção foi desinstalar e reinstalar a extensão solr pecl:
sudo pecl uninstall solr
sudo pecl install -n solr
sudo service apache2 restart
Antes de desinstalar, notei que solr.so estava no lugar errado ( /usr/lib/php5/20100525/solr.so ). Após a desinstalação e reinstalação, é em /usr/lib/php5/20121212/solr.so que é encontrado pelo Apache, etc.