Existe um artigo no Wiki do Gentoo que descreve um problema com o modo de compatibilidade da BIOS que potencialmente está a abrandar acesso SSD.
Quando o MacBook usa o modo de compatibilidade do BIOS, ele alterna o controlador SATA para o modo IDE, tornando as operações do hdd / ssd mais lentas, já que o kernel usará o módulo ata_piix detectado do ahci. Parece que há algumas maneiras de mudar isso, mas este é o mais fácil, e na verdade é o único que funcionou para mim. Eu testei isso com o MacBook Pro 6.2.
Não parece que está na escala que você está falando, mas ainda sim algo a verificar.