Você pode usar o comando subst e associar uma letra de unidade a um caminho.
No entanto, você não pode usá-lo com um caminho UNC .
Tente usar:
net use * \ftp\server\path\to\folder
Então, no yout git bash, você pode:
cd /d/...
(se D:\ era a letra da unidade associada a esse caminho)