Esta pode não ser uma resposta completa, mas acho que vale a pena.
"... não havia disco do windows incluído ..." - Grave seus discos de "Recuperação" do computador. Eles geralmente não enviam mais discos do Windows.
Eu recomendo ir com um único SSD SATA menor (ou dois menor) em vez disso - a velocidade em que será melhor do que o USB. Se você usar um RAID1 espelhado (Espelhado), perderá ~ 10-15% (se bem me lembro) da velocidade das unidades. Se você usar o RAID0, seu desempenho será um pouco melhor.
A velocidade do USB 3 atinge o máximo de 5 Gb / s. SATA é 6 Gb / s. Em ambos os formatos, o gargalo será o inversor ou o controlador de unidade (controlador RAID no seu caso). Você terá menos gargalos de controle se usar um RAID0.
Se você quiser usar algum tipo de RAID remoto, recomendo um dispositivo NAS com RAID. Mas e a velocidade? 1 Gb / s não é suficiente? As chances são de que seu computador não vai usar muito regularmente de qualquer maneira. A menos que você esteja executando um sistema operacional deste (e eu não faria - inicialização dupla ou usar um VHD), você não vai notar a desaceleração muito, desde que você tenha Gigabit Ethernet ou maior execução em sua rede.
- Você compra um. Não construa um.
- Sim, o 3.0 tem uma velocidade máxima de 5 Gb / s em todo o barramento, embora seu chipset também possa ser um problema (USB para chipset pode ser uma conexão mais lenta que 5 Gb / s).
- Grave os discos do sistema operacional (discos de recuperação). Você pode instalar o GRUB / Linux como o dispositivo de inicialização, que então inicializará no Linux ou executará o bootloader do Windows. Se você formatar suas unidades e instalar o Linux primeiro, o Windows nem sempre funciona bem com outros sistemas de inicialização (como o GRUB).
Se você não quiser tocar no sistema operacional host, dê uma olhada na instalação em um VHD - basta adicionar uma opção de inicialização ao Windows, criar um VHD e inicializar no arquivo VHD através do bootloader do Windows. O VHD é apenas um arquivo no seu computador, não uma nova partição.