Você pode criar a VM inteira no SSD normalmente e mover os arquivos de imagem do disco rígido virtual para sua unidade grande e usar um link simbólico NTFS no local original para que o VirtualBox continue a ser executado a partir do SSD.
Ainda mais sofisticado, você pode criar duas unidades virtuais para sua VM e manter o arquivo para uma pequena unidade de inicialização no SSD e ter um host de arquivos maior no restante do sistema de arquivos ao vivo na grande unidade do host.
A Wikipedia tem uma boa página nos links simbólicos do Windows aqui: link