Eu experimentei o mesmo problema ao instalar o Field3D. Parece que o nome do arquivo é libboost_thread.so em vez de libboost_thread-mt.so . Portanto, é um bug e deve ser tratado alterando o termo no arquivo de origem.
Para o campo 3D, altere buildSupport.py . Procure o -mt e remova. Então o Scons é executado.
Veja também esta pergunta em stackoverflow .