Do meu conhecimento, isso teria que ser feito a partir do nível do aplicativo RDP. Sem foco na janela do RDP e na falta de um gancho de teclado global a partir do aplicativo RDP, não há como fazer isso além de transmitir mensagens diretamente para o processo que é confuso e não seguro para funcionar.
Em geral, o Windows considera uma janela "minimizada" e fora de foco e, portanto, não é segmentável até que o foco seja retornado ou a janela seja restaurada.