Sim, é mais natural usar uma caneta sensível à pressão em um tablet gráfico do que usar um mouse.
Se você analisar o processo, um mouse geralmente usa o braço inteiro e, se feito de maneira inadequada, envolve o braço em uma atividade que não estava na especificação original, levando a lesões por esforço repetitivo em todo o braço.
Uma caneta usa movimentos mais naturais dos dedos e dos pulsos e descobri que ela é muito mais fácil para um controle preciso.