Supondo que eu tenha lido sua pergunta corretamente, consegui definir o botão do meio do mouse para ativar a Escala da janela. Pelo que vejo, ele não faz mais parte das configurações padrão, mas você pode facilmente configurá-lo dessa maneira usando CCSM .
Depois de instalá-lo, abra o CCSM e pesquise Escala.
Em seguida, vá para a aba Bindings em Scale e clique em Initiate Window Picker (a terceira opção com um ícone do mouse ao lado).
Clique na caixa de seleção ao lado de Ativar e escolha Botão2 na lista suspensa.
Agora que todas as configurações estão definidas, efetue logout e login novamente e agora você poderá ativar o dimensionamento de janelas usando o botão do meio do mouse.