Primeiro, para a documentação do putty, consulte: link
Isso lhe dirá todos os argumentos de linha de comando suportados pelo Putty.
Se você quiser atalhos para as coisas, você provavelmente terá que criar arquivos * .bat e, em seguida, especificar um atalho na sua área de trabalho para ele. O arquivo * .bat pode conter comandos do Windows, mas lembre-se de que cada programa possui diferentes opções disponíveis.