O Openfire é um ótimo software!
Tente instalar o plug-in "User Import Export" na guia Plug-ins (em Plug-ins disponíveis). Em seguida, vá para a guia Usuários / Grupos e você verá a nova opção "Importar e exportar". Reverta o novo sistema e esperamos que facilite a migração!
BTW: o banco de dados embutido é HSQL e usa a string de conexão:
jdbc:hsqldb:/opt/openfire/embedded-db/openfire
se você tem um pouco de know-how em Java, você pode se conectar ao mesmo banco de dados e escrever um script para exportar os dados para qualquer formato que preferir, em seguida, insira em seu banco de dados MySQL. O esquema deve ser o mesmo em ambos os bancos de dados (eu acho!).