Eu encontrei o motivo: por um motivo desconhecido, o Thunderbird havia desativado todos os temas instalados - até mesmo o padrão.
Quando a atualização foi realizada, o tema padrão estava ativo, mas dois temas incompatíveis mais antigos ainda estavam instalados. A exclusão dos dois temas antigos e a ativação do tema padrão trouxeram de volta os botões minimizar / maximizar / fechar.