como definir / organizar arquivos [de destino] na mesma estrutura de pastas que suas duplicatas estão na origem?

Question

Eu tenho duas unidades com os mesmos arquivos, mas a estrutura de diretórios é totalmente diferente.

For example, drive A has:
/foo/bar/123.txt
/foo/bar/234.txt
/foo/bar/dir/567.txt

Whereas drive B has:
/some/other/path/123.txt
/bar/doo2/wow/234.txt
/bar/doo/567.txt

como definir / organizar arquivos [de destino] na mesma estrutura de pastas que suas duplicatas estão na origem? plz ajuda !!!